به طور كلي هدف خدمات راهنمايي و مشاوره اين است كه به دانشجويان كمك كند از قرار گرفتن در مسـيرهايي كـه موجب تباهي توانمندي‌ها، استعدادها و شخصيت او مي شود جلوگيري نمايد. دانشجويان دانشگاه علوم پزشكي از سرمايه هاي معنوي و اجتماعي جامعه محسوب مي شوند، آنان گرانبهاترين و كمياب ترين سـرمايه‌هـاي اجتماعي هستند كه آسيب رسيدن به هر يك موجب تباهي بزرگي براي اكنون و آينده جامعه خواهـد بـود.
لذا براي مركز مشاوره دانشجويان بسيار مهم است كه هيچ دانشجويي در زنـدگي تحصـيلي، خـانوادگي،فردي، اجتماعي و معنوي خود دچار چالش‌هاي خطرناك نشود و چنانچه در اين راسـتا گرفتـار مشـكلاتي گرديد دست حمايت خود را مشتاقانه به سوي مشاوره دراز كند تا وي را در راستاي رسيدن به مرحلـه كمال انساني كه شايسته هستي او است ياري نمايند.

به طور كلي اهداف اين اداره عبارتند از :

1. رشد سلامت روحي و رواني دانشجويان
2. رشد و شكوفايي استعداد دانشجويان
3. پيشگيري از مسائل و مشكلات عاطفي- رفتاري
4. ارتقاء سطح كيفي و كمي بهداشت رواني دانشجويان
5. افزايش رضايتمندي دانشجويان و پرسنل دانشگاه از فعاليتهاي مركز راهنمايي و مشاوره
6. كاهش مشكلات رفتاري دانشجويان مثل افسردگي ، اضطراب و ...
7. افزايش زمينه استفاده دانشجويان و كاركنان از خدمات مختلف مركز مشاوره